A simple and efficient DNA isolation method for Ornithogalum L. species (Hyacinthaceae, Asparagales)

نویسندگان

  • Milica Rat
  • Živko Jovanović
  • Nemanja Stanisavljević
  • Boris Radak
  • Bojana Bokić
  • Svetlana Radović
  • Goran Anačkov
چکیده

We report an efficient, simple and cost-effective protocol for the isolation of genomic DNA from Ornithogalum species. Our modification of the standard CTAB protocol includes two polyphenol adsorbents (insoluble PVPP and activated charcoal), high NaCl concentrations (4 M) for removing polysaccharides, and addition of phenol to remove proteins and other contaminants. DNA yield obtained with our protocol was 223 and 312 μg DNA g-1 of dry leaf tissue. The absorbance ratio 260/280 nm was 1.879 (O. refractum) and 1.753 (O. sibthorpii), and the absorbance ratio 260/230 nm was 1.779 (O. refractum) and 1.545 (O. sibthorpii), revealing lack of contamination. PCR amplifications of one nuclear marker (26S rDNA) indicated that this DNA isolation protocol may be used for Ornithogalum plants containing many interfering compounds for further analyses in population genetics and phylogeographic studies.

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

ثبت نام

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

An efficient and simple CTAB based method for total genomic DNA isolation from low amounts of aquatic plants leaves with a high level of secondary metabolites

An efficient DNA isolation protocol specifically modified to get pure quality DNA required for molecular studieshas been reported in this paper. Some aquatic plants (Potamogeton spp., Ceratophyllum demersum and Myriophyllum spicatum) were used for the study. The protocol developed will be useful in getting high and pure DNA. Instead of using the available DNA extraction kits, this protocol can ...

متن کامل

The controversial telomeres of lily plants.

The molecular structure of the exceptional telomeres of six plant species belonging to the order Asparagales and two species of the order Liliales was analyzed using Southern blot and fluorescence in situ hybridization. Three different situations were found, namely: i) In the two Liliales species, Tulipa australis (Liliaceae) and Merendera montana (Colchicaceae), the chromosome ends display hyb...

متن کامل

گونه جدید Ornithogalum khuzestanicum (Hyacinthaceae)از خوزستان

Ornithogalum khuzestanicum  به عنوان گونه جدید از خوزستان شرح داده می‌شود. این گونه مشابه گونه‌هایO. brachystachys C. Koch  و O. arcuatum Stev. بوده و از نظر طول ساقه، حاشیه برگ، طول گل آذین، طول برگه، طول دمگل و تزیینات سطح بذر و دانه گرده با آنها اختلاف دارد.

متن کامل

مطالعه تشریحی برگ و ساقه گونه‌های جنس Ornithogalum از تیره Hyacinthaceae در ایران

در این پژوهش، آناتومی برگ و ساقه 11 گونه از جنس Ornithogalum از تیره Hyacinthaceae در ایران بررسی شده است. نمونه‌های گیاهی جمع‌آوری شده در محلول تثبیت‌کننده قرار گرفته، سپس برش‌های متعددی از آنها با دست تهیه شد که پس از رنگ‌آمیزی با رنگ‌های سبز متیل و کارمن و تهیه اسلاید، با میکروسکوپ نوری مطالعه شد. ویژگی‌های تشریحی مختلفی نظیر شکل مقطع ساقه، تعداد لایه‌ها، ضخامت و شکل سلول‌های بافت اسکرانشیم،...

متن کامل

A Simple and Rapid Leaf Genomic DNA Extraction Method for Polymerase Chain Reaction Analysis

In plants, secondary metabolites and polysaccharides interfere with genomic isolation procedures and downstream reactions such as restriction enzyme analysis and gene amplification. The removal of such contaminants needs complicated and time-consuming protocols. In this study, a simple, rapid and efficient method for leaf DNA extraction was optimized. This method use small amount of plant mater...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

ثبت نام

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

عنوان ژورنال:

دوره   شماره 

صفحات  -

تاریخ انتشار 2014